Диагностика вирусной РНК гепатита С

РНК вируса гепатита С может быть обнаружена в любой биологической жидкости человека, кроме крови, начиная со слюны и заканчивая жидкостью, которая скапливается в животе при развитии поражений печени. Естественным резервуаром или источником заражения обычно является человек-носитель вирусной инфекции. Но способность вируса гепатита С долгое время бессимптомно существовать в организме приводит не только к опасному состоянию больного, но и к вероятности потенциального заражения контактирующих с ним, в том числе посторонних людей.

Современные методы исследования позволяют обнаружить даже незначительное присутствие вирусных РНК. Для этого существуют методы, изобретенные в молекулярной биологии и поставленные на службу современной медицине в качестве эффективной диагностики.

Характер проблемы

В отличие от других вирусов гепатита человека, содержащих ДНК, опасный ВГС затруднительно выявить обычными лабораторными методами, и ранее проводимые исследования только показывали внешнюю несхожесть вируса с уже известными науке.

Вирус гепатита С очень сложно обнаружить при простых анализах.

Иммунодиагностика для вируса гепатита С неэффективна, потому что процесс заболевания протекает крайне своеобразно:

  1. Вирус быстро мутирует, а иммунный ответ организма запаздывает и не может бороться выработанными средствами, потому что они на момент продуцирования уже неэффективны.
  2. Период инкубации вируса в клетках может составлять до 26 недель, а это означает, что клиническая диагностика, особенно в безжелтушной, самой характерной для ВГС форме, практически невозможна.
  3. Лабораторная диагностика позволят выявить присутствие патогенного агента только через 6 месяцев в лучшем случае, когда появляются антитела к вирусу. Фульминантное течение, с которым пока невозможно справиться, встречается только у одного человека из ста.
  4. Отсутствие своевременной диагностики приводит к постоянному присутствию вируса в организме человека, с незначительными признаками, которые легко отнести к переутомлению или расстройствам пищеварения. И все это время он является потенциальным источником заражения, даже не подозревая о собственном вирусоносительстве.
  5. Если происходит репликация вируса во внепеченочном пространстве, у больного могут развиваться и тяжелые аутоиммунные реакции, и летальный исход от их присутствия.
  6. При подозрении на ОГС назначаются лабораторные анализы – как обязательные, так и дополнительные, при ХГС прибавляется обязательная дифференциальная диагностика, которую проводят с помощью таблицы маркеров. Однако общие анализы мочи и крови, биохимическое исследование и даже иммунотитрование недостаточно информативны.
  7. Выявление антител к ВГС и HBsAg – всего лишь свидетельство о контакте организма с вирусом. Но никаких объективных данных о его пребывании, развитии или угасании, репликации или ее отсутствии, иммунодиагностика не представляет. Общие антитела к Hepatitis C Virus можно трактовать вариабельно и их обнаружение не дает возможности определиться с врачебной тактикой.
Единственная возможность получить необходимые данные – обратиться к современным видам исследования, относительно недавно появившимся на вооружении вирусологии. Самым надежным из них считается метод полимеразной цепной реакции, позволяющей выявить даже самое незначительное присутствие РНК гепатита С.

Что представляет собой метод ПЦР

Метод полимеразной цепной реакции – диагностическая технология, в которой были использованы наработки молекулярной биологии. Ученые Хьелль Клеппе и Кэри Муллис сделали революционное открытие в своей области, разработав проведение ПЦР, позволяющей бесконечно увеличивать количество копий по заданной программе. Выбрав для копирования РНК вируса гепатита С можно выявить с помощью комплементарных праймеров и ДНК-полимеразы даже самое незначительное количество, вплоть до одиноких и не связанных между собой фрагментов.

Для обнаружения вируса гепатита С проводится специальная ПЦР-диагностика.

Суть проводимого анализа состоит в выявлении присутствия вирусных рибонуклеиновых кислот задолго до того, как организм начнет вырабатывать иммунный ответ, который может обнаружить анализ на антитела к вирусу.

Никакие мутации не могут помешать обнаружению РНК, если есть соответствующая программа и специальные праймеры с полимеразой. В амплификаторе обнаруженная молекула тиражируется до уровня, который позволяет получить дальнейшую информацию. В современной медицине есть амплификаторы, способные выполнять и другие функции – например, сохранять размноженные молекулы на протяжении нужного времени или содержать флуоресцентные детекторы для работы с биоматериалом. Второе название анализа РНК на гепатит С (определение РНК вируса HCV-RNA) – ПЦР гепатита С. Это продуктивный способ выявления при исследовании крови человека частичек вирусного генома, проводимый в двух видах – качественном и количественном.

Качественный анализ

В настоящее время несколько менее актуален, чем количественный, потому что позволяет только определить присутствие вируса. Вариантов ответа – всего два – либо Hepatitis C Virus есть, либо его наличие не обнаружено. Успешность проводимой диагностики может быть легко поставлена под сомнение. Иногда чувствительность анализа недостаточно высокая, а концентрация вируса в крови настолько низкая, что тестовая система не может ее обнаружить. То есть даже внешне однозначный вариант ответа – вируса нет, на самом деле означает или его отсутствие, или концентрацию, которая пока недоступна проводимому тесту.

Существует также качественный анализ на гепатит С.

У конкретного пациента может быть низкий удельный уровень содержания РНК вируса из-за того, что он принимает по другому поводу противовирусные препараты. Но и положительный ответ тоже малоинформативен, потому что не дает представления о том, на какой стадии находится заболевание. Это может быть первичное заражение, развитие патологического процесса, его угасание, и даже то, что осталось после самоисцеления пациента, что тоже иногда случается.

После обнаружения антител качественный анализ может проводиться неоднократно, через 1, 3 и 6 месяцев, а затем по разу в год. Этот вид исследования называют первой стадией, потому что это – только выявление в крови пациента генетического материала патогенного агента.

Количественный анализ

Нередко отождествляется с вирусной нагрузкой, однако, дает и некоторые дополнительные данные. Получение результата производится методом подсчета количества единиц однониточного РНК вируса в миллилитре крови (другого биоматериала). Самая высокая чувствительность – у транскрипционной амплификации.

РНК вируса гепатита С может быть обнаружена при количественном анализе.

Пока этот метод находится в стадии разработки и есть только в крупных медицинских центрах, но это позволяет увидеть10 МЕ или 25 копий в 1 мг, в то время как более дешевый метод разветвленной ДНК видит только500 МЕ (1250 копий), то есть эффективность его в десять раз ниже.

С помощью количественного анализа решается сразу несколько задач. Можно:

  • диагностировать заражение на том этапе, когда остальные методы бессильны (в ничем не проявляемом инкубационном периоде);
  • определить самоизлечение, в то время как остальные методики дадут картину заражения, ориентируясь на выработанные организмом антитела;
  • составить представление об агрессивности генома и степени поражения клеток, с помощью присутствующих компонентов;
  • осуществлять мониторинг концентрации РНК вируса при назначении медикаментозной терапии – дает ли она ожидаемые результаты, или необходима смена врачебной тактики.
Но даже выявление РНК вируса гепатита HCV с помощью качественного анализа может быть не до конца результативным. Проблема заключается в уровне аппаратуры, на которой проводилось исследование. Ведь типы амплификаторов есть разные, как и наличие в конкретной лаборатории праймеров, ДНК и полимераз. У вирусологов есть профессиональное полушутливое утверждение, что вирус не обнаружен не потому, что его нет, а потому что под рукой нет подходящей аппаратуры.

Генотипирование

Вирус гепатита С – это общее собирательное название нескольких вариантов генотипа, официально признанных – 6, однако, в специальной литературе называются разные цифры (от 8 до 11). Распространенность генотипа на определенной территории не означает, что его нельзя обнаружить на другой, нехарактерной. Генотипирование выявляет не только типы генома, получившие статус квазивируса, но и его мутировавшие разновидности, в то время как тест на антитела не смог бы обнаружить присутствие видоизмененной инфекции.

Есть также такой метод диагностики как генотипирование.

В некоторых случаях проведение генотипирования тоже может привести к неудачным результатам. Если соответствующего реагента в лаборатории нет в наличии, выдается заключение о невозможности проведения типирования РНК, хотя субтип генома присутствует в организме и развивается со всеми вытекающими из этого последствиями.

Генотипирование РНК вируса гепатита С дает три результата – обнаружен конкретный генотип (субтип), есть РНК редкого вида, для идентификации которого нет ресурсов, или полное отсутствие, означающее, что пациент здоров или концентрация однонитчатой РНК совсем незначительна.

Ссылка на основную публикацию